Notranja pudendalna vena se nahaja v glutealni (zadnjici) regiji.
Leži med sakrospinozno vezjo in sakrotuberno vezjo na zadnjici ter zadaj (zadaj) ishialne hrbtenice, ki je predel kosti, ki štrli iz spodnjega dela medenice.
Notranja pudendalna vena leži ob notranji pudendalni arteriji, ki v isto regijo pripelje kisikovo kri. Pudendalni živec leži tudi ob teh dveh krvnih žilah in inervira isto regijo. Notranja pudendalna vena, notranja pudendalna arterija in pudendalni živec so povezani v debelo plast tkiva, imenovano obturator internus fascia. Ta združena skupina se imenuje pudendalni kanal.
Notranja pudendalna vena odvaja iz presredka kri, ki je osiromašena s kisikom, to je območje med zunanjimi genitalijami in anusom ter zunanjimi genitalijami. Izsušena regija vključuje čebulico penisa (pri moških) ali klitorisa (pri ženskah), analno regijo in urogenitalno regijo.
Pritoki notranje pudendalne vene vključujejo veno čebulice (pri moških), zadnjo labialno veno (pri ženskah), skrotalno veno (pri moških) in spodnjo rektalno veno. Notranja pudendalna vena se odteče v notranjo iliakalno veno. Kljub svoji lokaciji globoka hrbtna vena, ki odvaja erektilna telesa penisa (pri moških), ne prehaja v notranjo pudendalno veno.